Les Messerschmitt 109 de tous types ayant survécu aux combats et aux nombreux accidents durant la période du conflit, continuent leur travail de défense en “temps de paix”. Ils font encore la joie de nombreux pilotes qui peuvent apprécier leurs bonnes qualités de vol.
 
Le 20 novembre 1946, une première sélection des appareils usés et déclarés “hors service” est effectuée, mais ils sont rayés des registres et probablement ferraillés le 14 août 1948.
 
Une deuxième tranche d’avions subit le même sort, le 1^er octobre 1947 et ferraillés le 28 décembre 1949. Certaines de ces machines sont démontées pour être utilisées par des fabriques d’armements afin de tester de nouvelles munitions. Parmi ces Messerschmitt, certains avaient accompli de 300 à 400 heures de vol, pour les plus résistants.

La Suisse a donc possèdé : 10 Me 109 D-1 ; 80 Me 109 E-3 ; 8 Me 109 E-3 sous licence ; 2 Me 109 F-4 ; 13 Me 109 G-6 et 1 Me 109 G-14. Soit un total de 114 Messerschmitt de tous types.

De nombreuses pièces de Me 109 sont employées pour la fabrication de l’avion d’entraînement suisse Pilatus P-2, sur lequel on peut retrouver les trains d’atterrissages montés inversés, les palonniers, l’ensemble de la roulette de queue et d’autres accessoires moins importants.

Il semble même que des vedettes de la police maritime sur les lacs ont utilisé des moteurs Daimler-Benz de Me 109.

Seul subsiste le Messerschmitt 109 E-3 codé J-355 Wk.Nr. 2422 actuellement visible au musée militaire de Dübendorf.