En mars 1937 à Séville arrivent les douze premiers Messerschmitt Bf 109 B-1 de la Légion Condor. Les appareils sont livrés en pièces détachées qu'il est nécessaire d'assembler et régler. 
Les premiers vols s'effectuent dès le mois suivant au sein de la 2.J/88 commandée par l'Oblt Günther Lützow. Les pilotes allemands enregistrent leurs premières victoires contre les Républicains au début du mois de juillet 1937. Au même moment, 17 autres Bf 109 B-2 équipés d'une hélice à pas variable arrivent en Espagne. Ces avions sont principalement destinés à la 1.J/88 dont les Heinkel 51 commencent à montrer des signes de fatigue. Les Messerschmitt participent à toutes les offensives qui se succédent en Espagne, à tel point qu'en juin 1938, la J/88 ne dispose plus que de dix Bf 109 opérationnels. 
Un nouveau contingent de Bf 109 C-1 et D-1 est livré à temps pour permettre la constitution d'une troisième Staffel : la 3.J/88 commandée par l'Oblt Werner Mölders. En octobre 1938, quelques pilotes espagnols se joignent aux pilotes allemands afin de se familiariser avec le Messerschmitt dont il est prévu d'équiper une unité nationaliste. C'est à cette époque qu'arrivent les premiers Bf 109 E-1 et E-3 plus sophistiqués. La dernière victoire d'un Messerschmitt Bf 109 E-3 de la Légion Condor contre l'aviation Républicaine a lieu le 6 mars 1938. Le 27 mars suivant voit le dernier vol de guerre de cette terrible guerre civile. Les adieux officiels ont lieu le 27 mai et les avions survivants des séries B-2, E-1 et E-3 sont laissés aux espagnols, tandis que les C-1 et D-1 retournent en Allemagne. La Légion Condor perd près de quarante Messerschmitt en une année de combats, mais les enseignements seront précieux pour les pilotes allemands qui ont survécu.